Re: Hilfe von Brandstellenprofis gesucht!

Hallo Bernd,

danke für Deinen erhellenden Kommentar!
Den BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) mußte ich jetzt auch erst mal gschwind nachgoogeln. Es ist, wie ich glaube verstanden zu haben, ein mathemathischer Algorithmus um die Wahrscheinlichkeit genetischer Zusammengehörigkeit zu eruieren?
Ich hab mir den von Dir zitierten Artikel angesehen.Ich muß offen zugeben, daß ich diese Claden-Bäume noch nicht richtig "lesen" kann. Wenn Du nicht gesagt hättest, daß das zwei "deutlich unterschiedliche Sequenzen" sind, wären die für mich einfach nur sehr nah beieinander gelegen.
"Genbank" kannte ich natürlich überhaupt noch nicht! Ich war völlig platt, daß da 149 Datensätze zu Pyronema (mit Angabe der auswertenden Literatur) vorliegen. Da tun sich wirklich Welten auf, von denen ich keine Ahnung habe/hatte!
Ich war wieder heute an der Brandstelle. Der Pilz breitet sich weiter aus auf der Asche. Ich werde mir demnächst wieder eine Probe ziehen und schaun, wie er diesmal aussieht.

Herzliche Grüße,

Martin

Hallo Martin,
früher dachte ich genauso wie der Heinz, dass es nur eine Art gibt. Immerhin
muss man bedenken, dass das sehr schnelllebige Pilze sind, sie zählen wohl
zu den schnellsten Pionieren auf einem durch Feuer sterilisierten
Substrat.
Ein Pilz, der davon lebt, als erster an einer Stelle zu fruktifizieren, so
könnte man denken, hat vielleicht jedesmal etwas andere Sporenmaße und
Eigenschaften (mit oder ohne rosa Subiculum und so weiter).
Aber: Eine der führenden Mykologinnen auf diesem Gebiet ist Karen Hansen in
Stockholm, und sie zeigt in "Perry, Hansen & Pfister (2007),
Mycological Research 111, 549-571" (S. 558) einen
molekular-phylogenetischen Baum mit zwei deutlich unterschiedenen
Sequenzen P. omphalodes u. P. domesticum.
Auch wenn ich in den Nucleotid-Teil der Genbank gehe und von einer der
Pyronema-Sequenzen im Internet einen BLAST mache, dann zeigen die
Sequenzen dieser beiden Arten einen kleinen Unterschied.
Falls einige Forumsleser glauben, dass das, was ich hier schreibe, eine
schwierige Materie ist: Keine Angst vor DNA-Sequenzbetrachtungen. Die sind
ja mittlerweile in allen Pilzzeitschriften "angekommen".
Herzliche Grüße in Richtung Süden!
Bernd